猪見て矢を引く

自動撮影カメラと統計を使って野生動物を研究している博士学生です.日々の勉強のアウトプットを投稿します.

NIMBLEで並列化するための関数

MCMCをRで行うときに,たぶん一番良く使われるのはStanだと思います. しかし,前の記事でも書きましたが,Stanはアルゴリズムの都合上,離散値パラメータの推定を行えません... 生態学の研究では(他の分野はどうなんだろう)個体数などの離散値パラメータ…

GARMIN社製のGPSにフリーマップを入れる方法

GARMIN社製のGPSにフリーの地図をいれる事になったので,その手順の備忘録です. 機種 Garmin GPSMAP 64s Garmin GPSMAP 62s ちなみにこのGPS,日本語対応版の値段がめちゃくちゃ高い... (確か2倍近く高い) 機能や性能に変わりはないので,海外版を買って…

N-mixture modelをStanで実装してみた

Stanで実装するのは一苦労 N-mixtureモデルは二項混合モデルとも呼ばれ,2004年にRoyleが発表したモデルです.このモデルは,個体群が閉鎖している期間内に,空間・時間的に反復計測したカウントデータから検出率を考慮して個体数を推定するものです.詳しく…